Nepleťte si pojmy s dojmy.
Oprávnění tedy CHMOD, který se snažíte změnit
není nastavení VLASTNÍKA složek a souborů. Phoca Commander vám nemění VLASTNICTVÍ složek a souborů. Prakticky toto nemáte šanci v nějakém správci jednoduše změnit.
Malé tipy, jak to vyřešit:
1. vytvořte si web kompletně na local a poté přeneste (viz. předchozí příspěvek ernsta)
2. nainstalujete do stávající Joomly Akeeba Backup, vytvoříte kompletní zálohu, tuto stáhnete přes FTP na vaše PC. Smažete kompletně obsah webu (složky, soubory i databázi), nahrajete soubor zálohy + kickstart.php, spustíte a nainstalujete Joomlu ze zálohy. Vše bude také správně a bude fungovat.
3. vše smažte (složky, soubory i databázi) a začnete čistou instalací Joomly, dle tohoto návodu:
www.bongovo.cz/joomla/12-jak-spravne-nainstalovat-joomlu
Samozřejmě ve všech případech se pak už nikdy nesmíte ve stránkách rejpat přes FTP manager.