Ten způsob úpravy měl být jiný, na původní soubor nešahjte, nechte je tak jak jsou. Odkopírujte si je ze složky includes o úroveň výš, Přidejte define('_JDEFINES', 1); a upravte stávající hodnoty pro JPATH_BASE a JPATH_CONFIGURATION.
Pokud to jen přidáte na konec, o pár řádek výš to již máte nadefinované a k redefinici nedojde.
Navíc pokud jste upravoval přímo původní includes/defines.php tak to nastavení JPATH_BASE je nesmysl, tím říkáte že celá Joomla je v podadresáři includes.